超声波细胞破碎仪是利用一种超声波在液体中产生空化效应的多功能、多用途的仪器；它能用于各种动植物细胞、病毒细胞、细菌及组织的破碎，也可用于各类无机物质的破碎重组，同时可用来乳化、分离、匀化、提取、消泡清洗及加速化学反应等。安装到位后，检查各系统联接无误（进水管/出水管、排水管、冲洗水管、电源、电路），观察物料样品是否通过透明胶管进入主机进口，冷却循环水是否正常运转流通，然后操作相关按钮，使主机正常工作。具体步骤见下：
（1）接通总电源，整机通电。将钥匙插入工作/锁定转换孔，并旋到工作位置。
（2）进样杯中加满纯净水或缓冲液，按“液压泵”“开”按钮（绿色），油泵启动，供油压力输入主附油缸。
（3）按“主机”“开”按钮，机器正常运转（往复运动）。
（4）顺时针缓慢调节调压阀，使低压表、高压表压力同步上升，根据样品种类，调节破碎压力（200Mpa以下）。
（5）当纯净水或缓冲液到达进样杯颈部时，按“主机”“关”按钮，机器停止运转。将待破碎样品加入进样杯中，按“主机”“开”按钮，细胞破碎开始。经均质阀破碎后的样品，沿循环冷却管路冷却后，从出样口流出，样品一次破碎完成（可根据需要，进行多次破碎）。
（6）样品破碎完后，逆时针调节调压阀，使右边低压表至“0”位，加入纯净水或75%酒精进行清洗，直至出样清澈。
（7）按左边红色“主机”“关”按钮，再按右边红色“液压泵”“关”按钮；逆时针打开卸压阀，使高压表回“0“位。卸压完毕后，立即顺时针关上卸压阀。
（8）关掉总电源，拔掉电源线。